RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 OPN1MWP04001 364 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 VSIG8P0DPA2 414 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 SSTR5P35346 364 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 GNG10P50151 68 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 PROK1P58294 105 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 HTD2P86397 168 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 RNF144BQ7Z419 303 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 PRR18Q8N4B5 295 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 CITED1Q99966 193 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 HSF4Q9ULV5 492 aa6.98□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 HSPA12AO43301 675 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 CD3GP09693 182 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 CGB7P0DN87 165 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 SLC25A4P12235 298 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 TMEM11P17152 192 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 CHATP28329 748 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 GDNFP39905 211 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 PKIAP61925 76 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 SLC35B1P78383 322 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 KIR2DS1Q14954 304 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 MOB3BQ86TA1 216 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 GAPTQ8N292 157 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 TMEM104Q8NE00 496 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 OR4K15Q8NH41 348 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 PTX4Q96A99 478 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 RAB3CQ96E17 227 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 C14orf144Q96I85 54 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 S1PR3Q99500 378 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 A0A1W2PP11 408 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 RNF222A6NCQ9 220 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 DGCR2P98153 550 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 Q8N2B8 174 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 STOML3Q8TAV4 291 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 RAB24Q969Q5 203 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 OR4F4Q96R69 305 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 SHISA3A0PJX4 238 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 SMIM30A4D0T7 59 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 IFITM5A6NNB3 132 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 SERPINE3A8MV23 424 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 C15orf65H3BRN8 121 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 KCNAB3O43448 404 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 YPEL1O60688 119 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 ADCYAP1P18509 176 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 CD1BP29016 333 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 MAS1LP35410 378 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 SCAND1P57086 179 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-208ENST00000558285 TMEM219Q86XT9 240 aa6.96□□□□□ -1.3
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