RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2K	P61086	200 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777	PRSS8	Q16651	343 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777		Q8N402	240 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777	SNAPC3	Q92966	411 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777	SSR3	Q9UNL2	185 aa		12.21	□□□□□ -0.45
DDX11-222	ENST00000542777	TNC	P24821	2201 aa		12.21	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	RAB27B	O00194	218 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	MFNG	O00587	321 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	MPPED1	O15442	326 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CRYZL1	O95825	349 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	IFNA6	P05013	189 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	DDB2	Q92466	427 aa		12.2	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00473	A8K010	186 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	AIRE	O43918	545 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	OR2A4	O95047	310 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	SDC2	P34741	201 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	TALDO1	P37837	337 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	NCS1	P62166	190 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	MXD1	Q05195	221 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ARFRP1	Q13795	201 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	PEMT	Q9UBM1	199 aa		12.19	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	IFITM5	A6NNB3	132 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777		J3QRK9	145 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	PRH1	P02810	166 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	RAB3B	P20337	219 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	RAB6A	P20340	208 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	MYL9	P24844	172 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	RHOG	P84095	191 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ATP5G2	Q06055	141 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	GPR107	Q5VW38	600 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZS49	121 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		12.18	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	BMPR1B	O00238	502 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ACTL6B	O94805	426 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	VBP1	P61758	197 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF45	Q02386	682 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	SPIN2A	Q99865	258 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	FCGR3B	O75015	233 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	TUSC2	O75896	110 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CD81	P60033	236 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CDK10	Q15131	360 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CTF1	Q16619	201 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	MMD2	Q8IY49	270 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		12.16	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	GABARAP	O95166	117 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	DTYMK	P23919	212 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ARL6IP1	Q15041	203 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CDNF	Q49AH0	187 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	GPR141	Q7Z602	305 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	NEURL2	Q9BR09	285 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	RETN	Q9HD89	108 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	LYST	Q99698	3801 aa		12.15	□□□□□ -0.46
DDX11-222	ENST00000542777	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF785	A8K8V0	405 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	OR2J3	O76001	311 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	TPPP	O94811	219 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	KCTD9	Q7L273	389 aa		12.14	□□□□□ -0.47
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.14	□□□□□ -0.47

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