RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 SOX14O95416 240 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 IGLV3-1P01715 115 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CSN2P05814 226 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 GYPBP06028 91 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ZNF44P15621 663 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CCL1P22362 96 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CALB2P22676 271 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 HTR1DP28221 377 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CTRLP40313 264 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 RPS27P42677 84 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 HAAOP46952 286 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 SLC35B1P78383 322 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 KLRD1Q13241 179 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 TMED1Q13445 227 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 LY6EQ16553 131 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 KLHL12Q53G59 568 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 TMEM42Q69YG0 159 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 HCP5Q6MZN7 132 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 Q6ZSR3 168 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ZNF429Q86V71 674 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 EGFL6Q8IUX8 553 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PNKDQ8N490 385 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CHST4Q8NCG5 386 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 OR51L1Q8NGJ5 315 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 OR8D4Q8NGM9 314 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 NDNFQ8TB73 568 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 GIPC3Q8TF64 312 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PP6455Q8WZ26 134 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CEP19Q96LK0 163 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 OR8B4Q96RC9 309 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CHST5Q9GZS9 411 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PBOV1Q9GZY1 135 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 OR51V1Q9H2C8 321 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 GPR84Q9NQS5 396 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 C19orf12Q9NSK7 152 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ARMC1Q9NVT9 282 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 FAM206AQ9NX38 181 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 TAS2R3Q9NYW6 316 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PIGLQ9Y2B2 252 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 R4GMQ9 66 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 V9GYQ6 96 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.77□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 A0A1B0GW55 424 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PRD5 423 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PRF3 423 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PRM7 423 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PQLC2LA1A4F0 135 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PSMB11A5LHX3 300 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 SNTNA6NMZ2 147 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 TOR1AO14656 332 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 FGF16O43320 207 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 SYNGR1O43759 233 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CHST1O43916 411 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CST1P01037 141 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 KRT8P05787 483 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 OCM2P0CE71 109 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 DUX4L2P0CJ85 424 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 DUX4L3P0CJ86 424 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 DUX4L5P0CJ88 424 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 DUX4L6P0CJ89 424 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 DUX4L7P0CJ90 424 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ANXA3P12429 323 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PRKACBP22694 351 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 COX7A1P24310 79 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CD34P28906 385 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 MYCNOSP40205 109 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 KCNJ3P48549 501 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 RBP2P50120 134 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ATP1B3P54709 279 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PRRX1P54821 245 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 DLX6P56179 175 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 EDDM3BP56851 147 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 GMFBP60983 142 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ESRRGP62508 458 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ACTA2P62736 377 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ACTG2P63267 376 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ACTC1P68032 377 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 ACTA1P68133 377 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CBX1P83916 185 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 CDK5Q00535 292 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 PAX5Q02548 391 aa2.76□□□□□ -1.97
RBM39-241ENST00000496183 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms