RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	RHOG	P84095	191 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF45	Q02386	682 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	CDK10	Q15131	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618		Q8N1Y9	231 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618		Q9H521	79 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	HMX3	A6NHT5	357 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	FCER2	P06734	321 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	CD36	P16671	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF773	Q6PK81	442 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	TNFSF12	O43508	249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ACTL6B	O94805	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	BRI3	O95415	125 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	CSN3	P07498	182 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	NEDD8	Q15843	81 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ZMAT4	Q9H898	229 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	BMPR1B	O00238	502 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2J3	O76001	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SCGN	O76038	276 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MYOD1	P15172	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ARPC4	P59998	168 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATG4B-223	ENST00000493618	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618		E7EUB6	86 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC22A5	O76082	557 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	KBTBD11	O94819	623 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	SSX9	Q7RTT3	188 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4S2	Q8NH73	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	MUC7	Q8TAX7	377 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	SNAPC3	Q92966	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	SPIN2A	Q99865	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618		S4R3C0	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	TEX22	C9J3V5	150 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618		H0Y980	276 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2A4	O95047	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	EDN2	P20800	178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	FCGR2C	P31995	323 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	TGFBR1	P36897	503 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATG4B-223	ENST00000493618	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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