RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	YPEL2	Q96QA6	119 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ETV7	Q9Y603	341 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RS1	O15537	224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SNX3	O60493	162 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	DFFB	O76075	338 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RPA2	P15927	270 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	GNB3	P16520	340 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	LINC00315	P59091	139 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	DEFB131A	P59861	70 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	LIPE	Q05469	1076 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ATP6AP1	Q15904	470 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PIGY	Q3MUY2	71 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	MNS1	Q8NEH6	495 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	OR4K15	Q8NH41	348 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	APOL4	Q9BPW4	351 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621		Q9N2K0	584 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	AASS	Q9UDR5	926 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	JPT1	Q9UK76	154 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621		S4R3C0	116 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621		A0A087WTM6	91 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ACTL6B	O94805	426 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	MT-ND2	P03891	347 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	CRYGB	P07316	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	GNRHR	P30968	328 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RRM2	P31350	389 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	CXCR4	P61073	352 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	DAD1	P61803	113 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	GNMT	Q14749	295 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RSU1	Q15404	277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	TNXA	Q16473	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SSX9	Q7RTT3	188 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF114	Q8NC26	417 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PXT1	Q8NFP0	134 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	FAM162A	Q96A26	154 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	FGGY	Q96C11	551 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	GALM	Q96C23	342 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PELI1	Q96FA3	418 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	C7orf34	Q96L11	122 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	CXorf58	Q96LI9	332 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	OR2A7	Q96R45	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	RNF2	Q99496	336 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SPIN2A	Q99865	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	EBF4	Q9BQW3	602 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	GID8	Q9NWU2	228 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	PRR32	B1ATL7	298 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621		K7EMT4	169 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	DHFR	P00374	187 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTC4-204	ENST00000486621	APOA2	P02652	100 aa		3.12	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms