RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGHV3-11P01762 117 aa14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TNXAQ16473 311 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCUN1D4Q92564 292 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHB2Q99623 299 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.56□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 OVOL1O14753 267 aa14.55□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SMIM18P0DKX4 95 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIR2DS2P43631 304 aa14.55□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.55□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.55□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.55□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNCP24821 2201 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACTL6BO94805 426 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 VBP1P61758 197 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF429Q86V71 674 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFSD4AQ8N468 514 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 MSGN1A6NI15 193 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 KBTBD11O94819 623 aa14.53□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 FCER2P06734 321 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAS2R46P59540 309 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPIN2AQ99865 258 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.53□□□□□ -0.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNFSF12O43508 249 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR2A4O95047 310 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 GABARAPO95166 117 aa14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ECI1P42126 302 aa14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 BORCS5Q969J3 196 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 USMG5Q96IX5 58 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR2A7Q96R45 310 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 EHFQ9NZC4 300 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PRSS3P35030 304 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 HERV-K104P61576 105 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 DYRK1AQ13627 763 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACSM6Q6P461 480 aa14.51□□□□□ -0.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.5□□□□□ -0.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM223BA6NKX1 122 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.49□□□□□ -0.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 AP3S1Q92572 193 aa14.49□□□□□ -0.09
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