RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CADM3	Q8N126	398 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241		M0QYG6	137 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FCN1	O00602	326 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	HPRT1	P00492	218 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CA2	P00918	260 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PSMB8	P28062	276 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	MAS1L	P35410	378 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R31	P59538	309 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RND3	P61587	244 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS8	Q16651	343 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RHOV	Q96L33	236 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	COMMD9	Q9P000	198 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241		V9GYH0	126 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	DISC1	C4P0D8	188 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF12	O43508	249 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	KBTBD11	O94819	623 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR2A4	O95047	310 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	F2R	P25116	425 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	AP3S2	P59780	193 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	NDP	Q00604	133 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FXYD3	Q14802	87 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241		H3BUA1	57 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ACTL6B	O94805	426 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CNIH1	O95406	144 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	BRI3	O95415	125 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	NQO2	P16083	231 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N402	240 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PRRT1	Q99946	306 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	BET1L	Q9NYM9	111 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	VWF	P04275	2813 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.46	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241		G3V318	75 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RAMP3	O60896	148 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN15	O95858	294 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	RLN1	P04808	185 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	CD40LG	P29965	261 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF79	Q15937	498 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PTPA-222	ENST00000445241	R3HDM4	Q96D70	268 aa		11.45	□□□□□ -0.58

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