RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 PRRT1Q99946 306 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 PARP11Q9NR21 331 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 MCUBQ9NWR8 336 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 STAB1Q9NY15 2570 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 PSMB11A5LHX3 300 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 FBXO24O75426 580 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 CNIH1O95406 144 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 VDAC1P21796 283 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 ZNF79Q15937 498 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 Q8N3U1 123 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 GPHA2Q96T91 129 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 OR51J1Q9H342 316 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-205ENST00000414009 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 ACTL6BO94805 426 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 HPRT1P00492 218 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 UBE2KP61086 200 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 STPG2Q8N412 459 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 TEX45Q8NA69 505 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 CITED1Q99966 193 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 SRRQ9GZT4 340 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 COPZ2Q9P299 210 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 CA2P00918 260 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 IGLV2-23P01705 113 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 F2RP25116 425 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 ERVK-16P61578 105 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 GNB1P62873 340 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 CX3CL1P78423 397 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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HPS1-205ENST00000414009 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.63□□□□□ -0.55
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HPS1-205ENST00000414009 COMMD1Q8N668 190 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 S100ZQ8WXG8 99 aa11.63□□□□□ -0.55
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HPS1-205ENST00000414009 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 LINC01548A6NM66 108 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 M0QZ24 198 aa11.62□□□□□ -0.55
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HPS1-205ENST00000414009 OPN1MWP04001 364 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 IGF1P05019 195 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 ZNF735P0CB33 412 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 NQO2P16083 231 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 PIGPP57054 158 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 TAS2R31P59538 309 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 KRTAP10-3P60369 221 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 FXYD3Q14802 87 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 SSX9Q7RTT3 188 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 ARPC1AQ92747 370 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 RHOVQ96L33 236 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 COMMD9Q9P000 198 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 FCN1O00602 326 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 RAMP3O60896 148 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 OR2A4O95047 310 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 CD28P10747 220 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 PI3P19957 117 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 CD40LGP29965 261 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 LPAR6P43657 344 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 RND3P61587 244 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 TNXAQ16473 311 aa11.61□□□□□ -0.55
HPS1-205ENST00000414009 ECSCRQ19T08 205 aa11.61□□□□□ -0.55
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