RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASTOR1Q8WTX7 329 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2M4Q96R27 311 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8D2Q9GZM6 311 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR51B5Q9H339 312 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 COQ10BQ9H8M1 238 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00472Q9H8W2 130 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 NT5MQ9NPB1 228 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 V9GYY5 206 aaPredicted RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP160Q12769 1436 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 OBSL1O75147 1896 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 B4DEV8 164 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 F8W1H4 67 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R233 179 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 HBE1P02100 147 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPI1P17947 270 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSR1P43307 286 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABARAPL2P60520 117 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFDP2Q14188 446 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCN2Q14257 317 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANGPT1Q15389 498 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 XAF1Q6GPH4 301 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCC3Q6UW78 93 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 VTCN1Q7Z7D3 282 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEN1Q86WV5 123 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAP18Q8IXM2 172 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAND5Q8N907 189 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2D3Q8NGH3 330 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf40Q8WZ69 217 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYNLL2Q96FJ2 89 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00208Q96KT6 92 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RILPQ96NA2 401 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM147Q9BVK8 224 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMM22Q9Y584 194 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIPA1L1O43166 1804 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PPE3 182 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NN06 94 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCAPO15273 167 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 PROSCO94903 275 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPC1LP0DKB6 136 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 EVI2AP22794 236 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CA8P35219 290 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPT1P50897 306 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB1P60022 68 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB2AP61019 212 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBP5P82980 135 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D28Q2M2D7 210 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLRA4Q5JXX5 417 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMC12Q5T9G4 340 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFAF7Q7L592 441 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q8N402 240 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10J5Q8NHC4 309 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPTC7Q8NI37 304 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB1CQ92928 201 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCN3Q96D15 328 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFRP2Q96HF1 295 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 FMC1Q96HJ9 113 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM56Q96MV1 263 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC29A1Q99808 456 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRACR2AQ9BSW2 395 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB20Q9NX57 234 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
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RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0B4J2E0 115 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0G2JMM0 328 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PPB8 328 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PRS3 328 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB29O14966 203 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT1BP07438 61 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 HTR1AP08908 422 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPINK8P0C7L1 97 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD79AP11912 226 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX7CP15954 63 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 M6PRP20645 277 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK2P24941 298 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPA13P48723 471 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 MP68P56378 58 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB25P57735 213 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf194Q5T5A4 169 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 IDNKQ5T6J7 187 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 LUZP2Q86TE4 346 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-172P-201ENST00000411000 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
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