RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TRGV3P03979 118 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 PTHLHP12272 177 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 ZP3P21754 424 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 CBX5P45973 191 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R20P59543 309 aa9.47□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.47□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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PRAME-204ENST00000403441 RORCP51449 518 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 Q8N1Y9 231 aa9.46□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 ELK1P19419 428 aa9.45□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.45□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 POC5Q8NA72 575 aa9.44□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 TUBA4BQ9H853 241 aa9.44□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 PPYP01298 95 aa9.43□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 HAGHQ16775 308 aa9.43□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 BVESQ8NE79 360 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 AP3S1Q92572 193 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 LYSTQ99698 3801 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 SULT1C2O00338 296 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A17O43808 307 aa9.42□□□□□ -0.9
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PRAME-204ENST00000403441 UBE2KP61086 200 aa9.42□□□□□ -0.9
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