RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000048493.11

Rpap1-201, Transcript of RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rpap1, Length 4,744 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Trappc2lQ9JME7 139 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Mlf1Q9QWV4 267 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 NpffQ9WVA8 114 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Fcrl6A1YIY0 268 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 DffbO54788 344 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 P2rx6O54803 389 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 TfpiO54819 306 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Ier3P46694 153 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 St8sia5P70126 412 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Zic2Q62520 530 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr335-psQ7TRY6 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 D330020A13RikQ8C799 211 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Nmnat3Q99JR6 245 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Epdr1Q99M71 224 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Cst6Q9D1B1 149 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr555E9Q547 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Gm4788E9Q8B5 879 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 H2-DMaP28078 261 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rhox4gQ2MDF7 205 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rhox4dQ2MDG0 205 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 MidnQ3TPJ7 465 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Klhdc2Q4G5Y1 406 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rhox4eQ504P9 205 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 HrasQ61411 189 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Dhrs7cQ8CHS7 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rcc1Q8VE37 421 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Tmem144Q8VEH0 348 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr1238Q8VG59 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr980Q8VH08 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rhox4bQ9JI43 205 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Pom121l12A0A1B0GSJ4 278 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Zdhhc22A0PK84 263 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr872E9PVW2 323 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Onecut1O08755 465 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Pdcd6P12815 191 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Cox7a2P48771 83 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Vmn1r236Q05A06 334 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Trp53rkaQ5U452 244 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Cfhr1Q61406 343 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Paqr8Q80ZE5 354 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 UmodQ91X17 642 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Tp53rkQ99PW4 244 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Susd3Q9D176 269 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Shisa5Q9D7I0 235 aa9.5□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Gm42420A0A0J9YUQ2 99 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr1335B2RVY8 335 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Prss2P07146 246 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Gabra6P16305 453 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 PtgfrP43117 366 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Vmn1r195Q5SVD6 316 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr1287Q7TQY1 305 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Trmt61aQ80XC2 290 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Fbxw19Q8C2W8 466 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Parp11Q8CFF0 331 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Neil3Q8K203 606 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Abhd12Q99LR1 398 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Ccl8Q9Z121 97 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Ascl4M0QW46 144 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Fabp9O08716 132 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Ifna6P07350 189 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Csf2rb2P26954 878 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rab7aP51150 207 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Pla2g5P97391 137 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Klk1b21Q61759 261 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 1700034E13RikQ9D2T6 108 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Fzr1Q9R1K5 493 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Zfp942B8JJA7 486 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Vmn1r114L7N226 321 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Vmn1r126L7N2C8 321 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 H2-M10.1O19443 331 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Hyal2O35632 473 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Mef2bO55087 349 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Gfi1bO70237 330 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr1042Q7TR81 313 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Klf11Q8K1S5 502 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Plrg1Q922V4 513 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Mrpl43Q99N89 183 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Lamtor1Q9CQ22 161 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Mmp16Q9WTR0 607 aa9.49□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Zfp707F6QUN2 391 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 P2ry1P49650 373 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Ascl1Q02067 231 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 G430049J08RikQ3TL09 166 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Prss35Q8C0F9 409 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr129Q8VEY1 330 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Olfr494Q8VG07 314 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Ethe1Q9DCM0 254 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 S1pr3Q9Z0U9 378 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Bcl3Q9Z2F6 448 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Gm8677K9J7G9 307 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Rdh9Q8K5C8 317 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Cysltr2Q920A1 309 aa9.48□□□□□ -0.89
Rpap1-201ENSMUST00000048493 Kcne4Q9WTW3 170 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.3 ms