RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C CKB2P38930 258 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C HXT6P39003 570 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C HXT7P39004 570 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C NET1P47035 1189 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YJR096WP47137 282 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YGL081WP53156 320 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C SPO1P53541 631 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C CPR8P53728 308 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C FDC1Q03034 503 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YMR210WQ03649 449 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C THI73Q07904 523 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C APM4Q99186 491 aa2.38□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C ELF1P36053 145 aa2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YKR075CP36155 307 aa2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C CDS1P38221 457 aa2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PXA1P41909 870 aa2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C DAK1P54838 584 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C NSE5Q03718 556 aa2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PPN1Q04119 674 aa2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PMA2P19657 947 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.36□□□□□ -2.03not detected
HDA3YPR179C TSR4P25040 408 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C MTC7P32633 139 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C UBP12P39538 1254 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PMT3P47190 753 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PIP2P52960 996 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C ECM9Q02202 377 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C FMP30Q02883 468 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C HFI1Q12060 488 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C NUP145P49687 1317 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C ERG11P10614 530 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C SEC15P22224 910 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C APN1P22936 367 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C GRX4P32642 244 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C TYS1P36421 394 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C MRPL7P36519 292 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data2.36□□□□□ -2.03not detected
HDA3YPR179C YEN1P40028 759 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C FTR1P40088 404 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YGR237CP50089 785 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C UME1Q03010 460 aa2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C CDC26P14724 124 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data2.35□□□□□ -2.03not detected
HDA3YPR179C MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C OAF3P36023 863 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C HOT13P36078 116 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C TDA3P38758 523 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C TMN3P40071 706 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C TAX4P47030 604 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YNL018CP53976 612 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RGT2Q12300 763 aa2.35□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C AAD3P25612 363 aa2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C CNE1P27825 502 aa2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C PRM2P40534 656 aa2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YDL183CP48569 320 aa2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C TAF4P50105 388 aa2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C GPG1P53130 126 aa2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa2.34□□□□□ -2.03
HDA3YPR179C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TUP1P16649 713 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C HOP1P20050 605 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C SEC65P29478 273 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C FAT1P38225 669 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C XBP1P40489 647 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YIP4P53093 235 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C MPS1P54199 764 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C ARR3Q06598 404 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C ZPS1Q12512 249 aa2.34□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C CPA2P03965 1118 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C GPP1P41277 250 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C BFA1P47113 574 aa2.33□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YGR153WP48238 217 aa2.33□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C SCS3P53012 380 aa2.33□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TIM50Q02776 476 aa2.33□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C USA1Q03714 838 aa2.33□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C NUP1P20676 1076 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YPT10P38146 199 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C PPE1P38796 400 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C LRO1P40345 661 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C THI6P41835 540 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C STB2P46679 850 aa2.32□□□□□ -2.04
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