RNA–Protein interactions for RNA: YMR073C

IRC21, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene IRC21, Length 606 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRC21	YMR073C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.1	□□□□□ -1.75
IRC21	YMR073C	PHO5	P00635	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IRC21	YMR073C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
IRC21	YMR073C	ELF1	P36053	145 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IRC21	YMR073C	BUD8	P41698	603 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IRC21	YMR073C	HLR1	Q04429	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IRC21	YMR073C	ULA1	Q12059	462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
IRC21	YMR073C	MDM10	P18409	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	IME1	P21190	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	RIM4	P38741	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	MIT1	P40002	666 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	NUP145	P49687	1317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	CPR8	P53728	308 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	UME1	Q03010	460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YHM2	Q04013	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YPS7	Q06325	596 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	OSW1	Q08692	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	AIM41	Q12032	185 aa		4.08	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	PTP1	P25044	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	PRE4	P30657	266 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	PPE1	P38796	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	TMN3	P40071	706 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	LTP1	P40347	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	SEC5	P89102	971 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	RIM13	Q03792	727 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	STP4	Q07351	490 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	APM4	Q99186	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	ERG11	P10614	530 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YMC1	P32331	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	OAF3	P36023	863 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	IES1	P43579	692 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	GLO1	P50107	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	SNF12	P53628	566 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	ECM9	Q02202	377 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	MFM1	Q02783	413 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	ORM2	Q06144	216 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	IRC3	Q06683	689 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	TGS1	Q12052	315 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	HFI1	Q12060	488 aa		4.06	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
IRC21	YMR073C	DGR2	P32330	852 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	TRS23	Q03784	219 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	ICT1	Q12385	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.05	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	STE4	P18851	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	LOT5	P34234	306 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YHR033W	P38690	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	HXT7	P39004	570 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YGR237C	P50089	785 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YGL117W	P53133	265 aa		4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	NUP1	P20676	1076 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
IRC21	YMR073C	FTR1	P40088	404 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	PRM2	P40534	656 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YIP4	P53093	235 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	YGL081W	P53156	320 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	ARG7	Q04728	441 aa		4.03	□□□□□ -1.76
IRC21	YMR073C	WHI2	P12611	486 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	AEP2	P22136	580 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	AAD3	P25612	363 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	CNE1	P27825	502 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	VID28	P40547	921 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	TAX4	P47030	604 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	YJR142W	P47173	342 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	COQ6	P53318	479 aa		4.02	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	APN1	P22936	367 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	MRPL7	P36519	292 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	APD1	P38281	316 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	NET1	P47035	1189 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	YAP7	Q08182	245 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.01	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	SEC12	P11655	471 aa		4	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	PMA2	P19657	947 aa		4	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	MRPL9	P31334	269 aa		4	□□□□□ -1.77
IRC21	YMR073C	TMT1	P32643	299 aa		4	□□□□□ -1.77

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