RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	GUD1	Q07729	489 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	YLR001C	Q07895	862 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI1	YMR025W	ATP23	P53722	227 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	PIH1	P38768	344 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	PXA1	P41909	870 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	YIP4	P53093	235 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	IRC3	Q06683	689 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	BEM3	P32873	1128 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	PPE1	P38796	400 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	STB2	P46679	850 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	BFA1	P47113	574 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	SPO1	P53541	631 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	YPL068C	Q02749	293 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	MFM1	Q02783	413 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	TUP1	P16649	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	MRPL7	P36519	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	ATG36	P46983	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	TIM50	Q02776	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	TFB2	Q02939	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	FDC1	Q03034	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	STP4	Q07351	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	YNL193W	P53870	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	PPN1	Q04119	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSI1	YMR025W	SWI6	P09959	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	CNE1	P27825	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	MRPL9	P31334	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CSI1	YMR025W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	COQ6	P53318	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	YNL018C	P53976	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	PRE4	P30657	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	TDA3	P38758	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	MEP2	P41948	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	NMD5	P46970	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	BUD17	P53727	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	RPC34	P32910	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	FTR1	P40088	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	MGS1	P40151	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	RET2	P43621	546 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	YJL043W	P47053	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	CDS1	P38221	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	OSW7	P43611	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	WHI2	P12611	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	IRC8	P47046	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	TAF4	P50105	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	RSC9	Q03124	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	HLR1	Q04429	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CSI1	YMR025W	APD1	P38281	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	DUN1	P39009	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	SNO3	P43544	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSI1	YMR025W	EUG1	P32474	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	EXO1	P39875	702 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	BST1	P43571	1029 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	IES1	P43579	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	TSR4	P25040	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	CKB2	P38930	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	PRM2	P40534	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YFL015C	P43578	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	NSE5	Q03718	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	HOP1	P20050	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YJR096W	P47137	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	SEC65	P29478	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	RGT1	P32862	1170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	MNT3	P40549	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	SAP4	P53036	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	BSP1	Q06604	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	TGS1	Q12052	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	GSY2	P27472	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	LOT5	P34234	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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