RNA–Protein interactions for RNA: YJR099W

YUH1, Transcript of Ubiquitin C-terminal hydrolase, yeast

Gene YUH1, Length 711 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YUH1	YJR099W	AFT2	Q08957	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	YMC2	P38087	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	MIT1	P40002	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	KHA1	P40309	873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	PIP2	P52960	996 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	VHS3	Q08438	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	POM34	Q12445	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	LAM4	P38800	1345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUH1	YJR099W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	VPS34	P22543	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	ORC2	P32833	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	NIT2	P47016	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MET14	Q02196	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	OSW1	Q08692	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RMP1	Q12530	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	GAL1	P04385	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PIF1	P07271	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	DAL3	P32459	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	NIC96	P34077	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	DID4	P36108	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	CTP1	P38152	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	COS111	P38308	924 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YGR153W	P48238	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MRK1	P50873	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PHO5	P00635	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	SEC15	P22224	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PTP2	P29461	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	TDA3	P38758	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	BIT61	P47041	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	DIP5	P53388	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	UBX4	P54730	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	FMP30	Q02883	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YFT2	Q06676	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YPT7	P32939	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YKR075C	P36155	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RIM4	P38741	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	BEM4	P39011	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RET2	P43621	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	SPC105	P53148	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	ECM9	Q02202	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RKI1	Q12189	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YMC1	P32331	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YKL133C	P36066	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	APL3	P38065	1025 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	IES5	P40060	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PMT6	P42934	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	SLD3	P53135	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PHM6	Q05637	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	ERG11	P10614	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	KIN82	P25341	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PET127	P32606	800 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YKU70	P32807	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	ELF1	P36053	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	EMP65	P40085	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	RIM13	Q03792	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MLC2	Q06580	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	NKP1	Q12493	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	NTH1	P32356	751 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	PTH2	P34222	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	MAL31	P38156	614 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	HIS6	P40545	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	SNF12	P53628	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	SKY1	Q03656	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YHM2	Q04013	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	YPS7	Q06325	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUH1	YJR099W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YUH1	YJR099W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YUH1	YJR099W	IZH3	Q07959	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUH1	YJR099W	YAP7	Q08182	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUH1	YJR099W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUH1	YJR099W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YUH1	YJR099W	NUP1	P20676	1076 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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