RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.76■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRA1Q86SQ6 560 aa29.76■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PIM2Q9P1W9 311 aa29.76■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CHD4Q14839 1912 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 MBD4O95243 580 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC4A3P48751 1232 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC93Q567U6 631 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SUPT20HQ8NEM7 779 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 IL27Q8NEV9 243 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 HSCBQ8IWL3 235 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TM6SF1Q9BZW5 370 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP21A2P08686 494 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK4P51957 841 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 DOK7Q18PE1 504 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMT1Q9H993 441 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ST18O60284 1047 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 LCORLQ8N3X6 602 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FGAP02671 866 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIK5Q16478 980 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PODNQ7Z5L7 613 aa29.71■■■□□ 2.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GNAT2P19087 354 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2IP78347 998 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD1Q99460 953 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-215ENST00000628018 G3V3G9 751 aa29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SOGA3Q5TF21 947 aa29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT32Q14532 448 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ALX1Q15699 326 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DBNDD1Q9H9R9 158 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYM6O95789 1325 aa29.68■■■□□ 2.34
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CAPNS1-215ENST00000628018 PSMA5P28066 241 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTO1P78417 241 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 AOC3Q16853 763 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SPON1Q9HCB6 807 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 APPP05067 770 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL34Q8N239 644 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ECE2O60344 883 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC14Q96N46 770 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKAB2O43741 272 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 RUFY3Q7L099 469 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIP5K2O43314 1243 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 LDHCP07864 332 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MCM2P49736 904 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CERS5Q8N5B7 392 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS33BQ9H267 617 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMA4Q16363 1823 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CPA1P15085 419 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXW7Q969H0 707 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK1Q96PY6 1258 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SCN9AQ15858 1988 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 E7EWF7 191 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF213O14771 459 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NACAP1Q9BZK3 213 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NAPBQ9H115 298 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP4CP60510 307 aa29.61■■■□□ 2.33
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