RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 A0A1W2PQ64 194 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 A0A1W2PQD8 194 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SPG7Q9UQ90 795 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 MBD3O95983 291 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 NLRP10Q86W26 655 aa8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 STX6O43752 255 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 TFCP2Q12800 502 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 CNTROBQ8N137 903 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 OSBP2Q969R2 916 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SEMA3EO15041 775 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ESPNB1AK53 854 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 COPS6Q7L5N1 327 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 GBP4Q96PP9 640 aa8.11□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 EYA2O00167 538 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ADD2P35612 726 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 CLSTN2Q9H4D0 955 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SLAIN2Q9P270 581 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 BMP6P22004 513 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 NT5C2P49902 561 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 EVI5O60447 810 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF18P17022 549 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 UBE3CQ15386 1083 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 STK31Q9BXU1 1019 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ANK1P16157 1881 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 DOCK1Q14185 1865 aa8.1□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 MGAMO43451 1857 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ST18O60284 1047 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 MCAMP43121 646 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 KDM4AO75164 1064 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 MAP3K9P80192 1104 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 TIGD1Q96MW7 591 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 INTS13Q9NVM9 706 aa8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 CCZ1BP86790 482 aa8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 LRRC24Q50LG9 513 aa8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 ANXA1P04083 346 aa8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 CERKQ8TCT0 537 aa8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 SBF1O95248 1867 aa8.08□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 E7EWF7 191 aa8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 LY9Q9HBG7 655 aa8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.07□□□□□ -1.12
PCAT5-201ENST00000626667 KIF28PB7ZC32 967 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms