RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 USP26Q9BXU7 913 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 NDUFB5O43674 189 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 TGFB1P01137 390 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 HGSNATQ68CP4 663 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 PDE3BQ13370 1112 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 CCNJLQ8IV13 435 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 A0A096LPE4 126 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1W2PPZ6 126 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 TIAF1O95411 115 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 SERPINB4P48594 390 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 GSTM4Q03013 218 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 PDE4CQ08493 712 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 CITED4Q96RK1 184 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 MAP3K1Q13233 1512 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1W2PP55 124 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 METTL12A8MUP2 240 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 PCDH1Q08174 1060 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 PRR19A6NJB7 356 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 CYP11A1P05108 521 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 RXRBP28702 533 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP4P98171 946 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 SGO2Q562F6 1265 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 FAM129BQ96TA1 746 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 TCF12Q99081 682 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-215ENST00000583289 CUX2O14529 1486 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 MED26O95402 600 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 DLGAP3O95886 979 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 SPINK2P20155 84 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 GRIA4P48058 902 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 USP11P51784 963 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ECM1Q16610 540 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 WDR64B1ANS9 1081 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 MCTP1Q6DN14 999 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 PAOXQ6QHF9 649 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 DTX1Q86Y01 620 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ATG3Q9NT62 314 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 B3GALT4O96024 378 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 DRD2P14416 443 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 POU4F3Q15319 338 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 EHD4Q9H223 541 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 NPHS2Q9NP85 383 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 PIM2Q9P1W9 311 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ADH5P11766 374 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ITPKAP23677 461 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 MAOBP27338 520 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ORC1Q13415 861 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 NFKBIBQ15653 356 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 RETREG2Q8NC44 543 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 CORO1BQ9BR76 489 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF576Q9H609 170 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ARAP1Q96P48 1450 aa6.54□□□□□ -1.36
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