RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C4BP0C0L5 1744 aa28.33■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa28.33■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.33■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EP400Q96L91 3159 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RFC4P35249 363 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APOBRQ0VD83 1088 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K12Q12852 859 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGEB6Q8N7X4 407 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLRP3Q96P20 1036 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC6Q86TZ1 520 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DYNC1I1O14576 645 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AP5Z1O43299 807 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APPP05067 770 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AIDAQ96BJ3 306 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF213O14771 459 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JAK2O60674 1132 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C4AP0C0L4 1744 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPHP1O15259 732 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCRN1Q12765 414 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DOCK2Q92608 1830 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELP1O95163 1332 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GUL6 1792 aa28.29■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GYG1P46976 350 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDCP20941 246 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT85P78386 507 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM13BQ9NYF5 915 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PFKFB2O60825 505 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE4AQ14139 1066 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FERMT3Q86UX7 667 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM173BQ6P4H8 233 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MBD4O95243 580 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX11Q96FC9 970 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRP2BPQ9P2M1 347 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPTLC3Q9NUV7 552 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCOA7Q8NI08 942 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP7D2Q96T17 732 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC192P0DO97 292 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LIG1P18858 919 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF3Q9H094 633 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARMT1Q9H993 441 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRC1O43663 620 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS37DQ86XT2 251 aa28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCF2Q9UG63 623 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFIXQ14938 502 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYRIPQ8NFW9 859 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.2■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANTXR2P58335 489 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM37O94972 964 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLRK1P26718 216 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRDNQ13061 729 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K11Q16584 847 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTDNEP1O95476 244 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCORLQ8N3X6 602 aa28.19■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.19■■■□□ 2.1
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