RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 LARGE1O95461 756 aa34.54■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 Q6ZUG5 572 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 SP8Q8IXZ3 490 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARMT1Q9H993 441 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLEC17AQ6ZS10 378 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ILDR2Q71H61 639 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALDH1B1P30837 517 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAST2Q6P0Q8 1798 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 UFL1O94874 794 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 HAND2P61296 217 aa34.51■■■■□ 3.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MSL1Q68DK7 614 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC83Q8IWF9 413 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFNL3Q8IZI9 196 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 NACAP1Q9BZK3 213 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMC3Q9UQE7 1217 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX11L8A8MPP1 907 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 FGD1P98174 961 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCORLQ8N3X6 602 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCOA7Q8NI08 942 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 SALL1Q9NSC2 1324 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR66Q8TBY9 1149 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGXT2Q9BYV1 514 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 LTBP1Q14766 1721 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXL16Q8N461 479 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 MASTLQ96GX5 879 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 NAPBQ9H115 298 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 PKP1Q13835 747 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC51AQ86UW1 340 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSG1L2A8MUP6 293 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRA1Q86SQ6 560 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D16Q8TBP0 767 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 DUOX1Q9NRD9 1551 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR19Q8NEZ3 1342 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRD1O95696 1058 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTMSP20962 102 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRDNQ13061 729 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZDHHC9Q9Y397 364 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 MCM5P33992 734 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRF1Q92994 677 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 MECOMQ03112 1051 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST3GAL1Q11201 340 aa34.44■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NBPF3Q9H094 633 aa34.41■■■■□ 3.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EVCP57679 992 aa34.36■■■■□ 3.09
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CTDNEP1-208ENST00000573600 APOBRQ0VD83 1088 aa34.35■■■■□ 3.09
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