RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 IGBP1P78318 339 aa9.52□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 USH1GQ495M9 461 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 CASC4Q6P4E1 433 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.51□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 TRPC3Q13507 836 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 STX1AQ16623 288 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 Q6ZUG5 572 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ATRIPQ8WXE1 791 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 FNBP1Q96RU3 617 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 CTR9Q6PD62 1173 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 NLRP3Q96P20 1036 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 NUCB1Q02818 461 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.51□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 VPS52Q8N1B4 723 aa9.5□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 KSR1Q8IVT5 923 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PDPR-210ENST00000568530 SUFUQ9UMX1 484 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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