RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN15	O95858	294 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	NFIC	P08651	508 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	CFP	P27918	469 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	RAP1GAP	P47736	663 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	CD8B	P10966	210 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	CES1	P23141	567 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	BNIP3	Q12983	259 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	OCLN	Q16625	522 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	NXPE3	Q969Y0	559 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPA1	O75762	1119 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB6A	P20340	208 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	XKR5	Q6UX68	686 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ABTB2	Q8N961	1025 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	STIM2	Q9P246	746 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	NETO1	Q8TDF5	533 aa		5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	VAV3	Q9UKW4	847 aa		5.42	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB39	O15060	712 aa		5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCQ	Q04759	706 aa		5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PMEPA1	Q969W9	287 aa		5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PRMT3	O60678	531 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTM4	Q03013	218 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	OSMR	Q99650	979 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRD	Q9H2X0	955 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	DYM	Q7RTS9	669 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	MLANA	Q16655	118 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	ASPA	P45381	313 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNMB1	Q16558	191 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP11A1	P05108	521 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSB	P07858	339 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	EDN3	P14138	238 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	MAOB	P27338	520 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CD96	P40200	585 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		5.35	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	ECM1	Q16610	540 aa		5.35	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		5.35	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		5.35	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT1	P04264	644 aa		5.34	□□□□□ -1.55

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