RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560350.5

USP3-AS1-206, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 407 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-206ENST00000560350 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 LILRA1O75019 489 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 DPEP1P16444 411 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 ST5P78524 1137 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 RELBQ01201 579 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 NYXQ9GZU5 481 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.76□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 CCER2I3L3R5 266 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 RAB15P59190 212 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 PARP10Q53GL7 1025 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 WWC1Q8IX03 1113 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 CNBD1Q8NA66 436 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 MBIPQ9NS73 344 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 HYPKQ9NX55 129 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.75□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC35F4A4IF30 521 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 ADH1AP07327 375 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 MYL6BP14649 208 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 KCNA3P22001 575 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 TTLL6Q8N841 843 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 BCS1LQ9Y276 419 aa9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRT76Q01546 638 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 COPS6Q7L5N1 327 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 IL27Q8NEV9 243 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 RNF217Q8TC41 542 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 CNKSR1Q969H4 720 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 HLFQ16534 295 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 SOGA3Q5TF21 947 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 STYK1Q6J9G0 422 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZBBXA8MT70 800 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 CHRNA5P30532 468 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 ALDH1B1P30837 517 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 TCIRG1Q13488 830 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 MASTLQ96GX5 879 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 FBXO45P0C2W1 286 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 NPR1P16066 1061 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 PTGIRP43119 386 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 STK31Q9BXU1 1019 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 SRGNP10124 158 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 TJP1Q07157 1748 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 KRT24Q2M2I5 525 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 NLRP3Q96P20 1036 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-206ENST00000560350 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms