RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531448.5

DEUP1-208, Transcript of deuterosome assembly protein 1, human

TSL 5

Gene DEUP1, Length 2,784 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DEUP1-208	ENST00000531448	GNG11	P61952	73 aa		27.84	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.84	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	BIN1	O00499	593 aa		27.83	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	LRRC31	Q6UY01	552 aa		27.83	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		27.83	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	BRF1	Q92994	677 aa		27.83	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.83	■■■□□ 2.05
DEUP1-208	ENST00000531448	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448		H3BQV1	296 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	IFFO2	Q5TF58	517 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	SUFU	Q9UMX1	484 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	CNPY4	Q8N129	248 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		27.82	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	REST	Q13127	1097 aa		27.81	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		27.81	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		27.81	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	CTAGE5	O15320	804 aa		27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	PPFIA3	O75145	1194 aa		27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	TUBB4A	P04350	444 aa		27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	MAP2K2	P36507	400 aa		27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	MYD88	Q99836	296 aa		27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	MAP2K7	O14733	419 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	SDF4	Q9BRK5	362 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	AOX1	Q06278	1338 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	CCDC102A	Q96A19	550 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	UTY	O14607	1347 aa		27.79	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	IL2RB	P14784	551 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	EVA1C	P58658	441 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	FSIP1	Q8NA03	581 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	DHX58	Q96C10	678 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	DONSON	Q9NYP3	566 aa		27.78	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	MNAT1	P51948	309 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	ATP1A3	P13637	1013 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	CNNM3	Q8NE01	707 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	RABGGTA	Q92696	567 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	NECTIN1	Q15223	517 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	GOLGA1	Q92805	767 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	CFAP45	Q9UL16	551 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		27.77	■■■□□ 2.04
DEUP1-208	ENST00000531448	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		27.76	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	TXLNA	P40222	546 aa		27.76	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	KCNJ6	P48051	423 aa		27.76	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	GCKR	Q14397	625 aa		27.76	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	CCDC151	A5D8V7	595 aa		27.75	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	CCP110	O43303	1012 aa		27.75	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	ME1	P48163	572 aa		27.75	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	LIG3	P49916	1009 aa		27.75	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		27.75	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	KAT2B	Q92831	832 aa		27.75	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	SIL1	Q9H173	461 aa		27.75	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		27.74	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	RPS6KA5	O75582	802 aa		27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	DPF2	Q92785	391 aa		27.73	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448		A0A1B0GVL5	298 aa		27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	FAM227B	Q96M60	508 aa		27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	USP28	Q96RU2	1077 aa		27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	HDX	Q7Z353	690 aa		27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		27.72	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	FANCC	Q00597	558 aa		27.71	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		27.71	■■■□□ 2.03
DEUP1-208	ENST00000531448	PNKP	Q96T60	521 aa		27.71	■■■□□ 2.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms