RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500025.2

CSTF3-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSTF3-AS1, Length 2,031 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 APBA3O96018 575 aa10.48□□□□□ -0.73
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.47□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MAP3K13O43283 966 aa10.47□□□□□ -0.73
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.47□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.47□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.47□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.47□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ST18O60284 1047 aa10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KIF4AO95239 1232 aa10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 HSPA4P34932 840 aa10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PTK7Q13308 1070 aa10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TCIRG1Q13488 830 aa10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 TNNI3KQ59H18 835 aa10.46□□□□□ -0.73
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.46□□□□□ -0.73
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