RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.11e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-212ENST00000491266 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM26DQ5JW98 314 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KLRG1Q96E93 195 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 NGLY1Q96IV0 654 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CFAP53Q96M91 514 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 STIM2Q9P246 746 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-212ENST00000491266 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF521Q96K83 1311 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC35F4A4IF30 521 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 APAF1O14727 1248 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 DGKZQ13574 1117 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ZIC5Q96T25 663 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 BCS1LQ9Y276 419 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCA3Q99758 1704 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 KDRP35968 1356 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 PHLPP1O60346 1717 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SOBPA7XYQ1 873 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MAN1A2O60476 641 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM13AO94988 1023 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MPSTP25325 297 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 PRKAR2BP31323 418 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 IER5Q5VY09 327 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 AIDAQ96BJ3 306 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 JCADQ9P266 1359 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTS2O95450 1211 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 F11P03951 625 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 HIF1AQ16665 826 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 RUNDC1Q96C34 613 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 KLK14Q9P0G3 267 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 PTSQ03393 145 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC27Q2M243 656 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SUSD3Q96L08 255 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 NUDCQ9Y266 331 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB39O15060 712 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 THBS1P07996 1170 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 IFT43Q96FT9 208 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 BTG4Q9NY30 223 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SLIT2O94813 1529 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1W2PNR3 127 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 FZD6O60353 706 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 NLRP8Q86W28 1048 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 LTN1O94822 1766 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MEGF6O75095 1541 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 ABCC6O95255 1503 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 DCTN1Q14203 1278 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 NFE2L2Q16236 605 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 STRN4Q9NRL3 753 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 DISP2A7MBM2 1401 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 MICAL2O94851 1124 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 TREML1Q86YW5 311 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 FBXO41Q8TF61 875 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.07□□□□□ -1.12
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