RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM11O75078 769 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL4DP49703 201 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 RAC1P63000 192 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FANCCQ00597 558 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K11Q16584 847 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SV2BQ7L1I2 683 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO11Q86XK2 927 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 TCF3P15923 654 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 COL8A1P27658 744 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF76P36508 570 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP12P59046 1061 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SULF2Q8IWU5 870 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 STK35Q8TDR2 534 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 KRBA1A5PL33 1030 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 DLL1O00548 723 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ECEL1O95672 775 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSBP07858 339 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 NME2P22392 152 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIK4Q16099 956 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 RASIP1Q5U651 963 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF34Q969K3 372 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 WISP1O95388 367 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ELNP15502 786 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP6P22004 513 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 LIG3P49916 1009 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 USP26Q9BXU7 913 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 CBX8Q9HC52 389 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 COPRSQ9NQ92 184 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 GGT7Q9UJ14 662 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 MAOBP27338 520 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 AP3B2Q13367 1082 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 POU4F3Q15319 338 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF394Q53GI3 561 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PDZD3Q86UT5 571 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 CORO1BQ9BR76 489 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 DLGAP3O95886 979 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP11A1P05108 521 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 SELPP16109 830 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ARNTP27540 789 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PHC3Q8NDX5 983 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMM50Q9Y512 469 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 RLBP1P12271 317 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 DUOXA2Q1HG44 320 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ACAD11Q709F0 780 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 USP48Q86UV5 1035 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms