RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 GRIK5Q16478 980 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 HIF1AQ16665 826 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 BRINP3Q76B58 766 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 NGLY1Q96IV0 654 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 TET3O43151 1660 aa7.19□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 DLL1O00548 723 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 WEE1P30291 646 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 STK32AQ8WU08 396 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 EID1Q9Y6B2 187 aa7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 F8W735 103 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 FAM35AQ86V20 835 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 MBD5Q9P267 1494 aa7.17□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.16□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 PLAURQ03405 335 aa7.16□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.16□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 ABI1Q8IZP0 508 aa7.16□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 FMN1Q68DA7 1419 aa7.16□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 PRR19A6NJB7 356 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 LGR5O75473 907 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 CPB1P15086 417 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 TYRO3Q06418 890 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 RTN1Q16799 776 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 ASIC4Q96FT7 647 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.15□□□□□ -1.26
CNN3-206ENST00000487539 ATRNO75882 1429 aa7.15□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 ABCC3O15438 1527 aa7.15□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 NWD1Q149M9 1564 aa7.15□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.15□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 GLB1P16278 677 aa7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 NFIAQ12857 509 aa7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 PIK3C2BO00750 1634 aa7.13□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.13□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 PRMT3O60678 531 aa7.13□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.13□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.13□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.13□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 ARID3AQ99856 593 aa7.13□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 ATF3P18847 181 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 IDI1Q13907 227 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 OCLNQ16625 522 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 PERM1Q5SV97 790 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 SUSD3Q96L08 255 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 PNMA5Q96PV4 448 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 EFCC1Q9HA90 598 aa7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 C1QTNF8P60827 252 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 IER5Q5VY09 327 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 Q6ZS46 218 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 COL26A1Q96A83 441 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 MYO19Q96H55 970 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 GSX2Q9BZM3 304 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.11□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 CEP152O94986 1710 aa7.1□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.1□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 NFKB1P19838 968 aa7.1□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 ATP2B4P23634 1241 aa7.1□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.09□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.09□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 RNF43Q68DV7 783 aa7.09□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.09□□□□□ -1.27
CNN3-206ENST00000487539 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms