RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484147.5

PTPN22-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,258 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-205	ENST00000484147	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FCHSD2	O94868	740 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RABEP1	Q15276	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNN1	Q92952	543 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	BCL9	O00512	1426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SGSM2	O43147	1006 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RTN2	O75298	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SMC2	O95347	1197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	POTEC	B2RU33	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NEBL	O76041	1014 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TPM1	P09493	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LTK	P29376	864 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF445	P59923	1031 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PKN1	Q16512	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CEP162	Q5TB80	1403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PEX14	O75381	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	AP1G2	O75843	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF24	P17028	368 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PTPRE	P23469	700 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	E2F5	Q15329	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PRRX2	Q99811	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147		F8VZ95	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147		H7C1W4	665 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	BDNF	P23560	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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