RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483418.1

NEB-212, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 3

Gene NEB, Length 643 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-212ENST00000483418 ECEL1O95672 775 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 B3GALT4O96024 378 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 MAPK8P45983 427 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 FAAP100Q0VG06 881 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.19□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 MEGF11A6BM72 1044 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 MAOBP27338 520 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 FDX2Q6P4F2 183 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 BCO2Q9BYV7 579 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.18□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 RAXQ9Y2V3 346 aa7.18□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 FSTP19883 344 aa7.17□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 USP35Q9P2H5 1018 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 STOML1Q9UBI4 398 aa7.16□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 HMX2A2RU54 273 aa7.15□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 TIAF1O95411 115 aa7.15□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 CYP11A1P05108 521 aa7.15□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 SGO2Q562F6 1265 aa7.15□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NEB-212ENST00000483418 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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NEB-212ENST00000483418 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.14□□□□□ -1.27
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NEB-212ENST00000483418 BEND4Q6ZU67 534 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.12□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.11□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 IGLV1-40P01703 118 aa7.11□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 AP3B2Q13367 1082 aa7.11□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.11□□□□□ -1.27
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NEB-212ENST00000483418 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 FBF1Q8TES7 1133 aa7.11□□□□□ -1.27
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NEB-212ENST00000483418 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.11□□□□□ -1.27
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NEB-212ENST00000483418 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 NFIAQ12857 509 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 PDE3AQ14432 1141 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 STK35Q8TDR2 534 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 WDR18Q9BV38 432 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 RNF19AQ9NV58 838 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.1□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 AOC2O75106 756 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 LIG1P18858 919 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 RXRBP28702 533 aa7.09□□□□□ -1.27
NEB-212ENST00000483418 ATP2B2Q01814 1243 aa7.09□□□□□ -1.27
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