RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 BCL11AQ9H165 835 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 LTN1O94822 1766 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ALPK3Q96L96 1907 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.46□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PALLDQ8WX93 1383 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ABCC11Q96J66 1382 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC7Q96M83 1385 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 CACNA1SQ13698 1873 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SMIM22K7EJ46 135 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 CLDN10P78369 228 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SIX5Q8N196 739 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ABTB2Q8N961 1025 aa5.46□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 NOD1Q9Y239 953 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.46□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 BPTFQ12830 3046 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 GYS1P13807 737 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 COL19A1Q14993 1142 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.45□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 TDHQ8IZJ6 230 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SHISA4Q96DD7 197 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 MAP10Q9P2G4 905 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.45□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 PTPN13Q12923 2485 aa5.45□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 C21orf2O43822 256 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ICMTO60725 284 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ABL1P00519 1130 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 IL2RBP14784 551 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 JUNDP17535 347 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 EPS15P42566 896 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 COPS2P61201 443 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 DDR1Q08345 913 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 KCNH2Q12809 1159 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 OCLNQ16625 522 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 DLK2Q6UY11 383 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 ASB16Q96NS5 453 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 FAM186AA6NE01 2351 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.44□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 MYO9BQ13459 2157 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 H3BRB1 525 aa5.43□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 DKK1O94907 266 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 FOSL2P15408 326 aa5.43□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 CTHP32929 405 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SEC13P55735 322 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.43□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
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SHQ1-208ENST00000482785 TLL1O43897 1013 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 NR1I2O75469 434 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 MAPK1P28482 360 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SCNN1AP37088 669 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 PTPN5P54829 565 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 THAP11Q96EK4 314 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.42□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.41□□□□□ -1.54
SHQ1-208ENST00000482785 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
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