RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 CLIC4Q9Y696 253 aa17.86■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 ZMYM6O95789 1325 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 AKAP11Q9UKA4 1901 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 C4AP0C0L4 1744 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 C4BP0C0L5 1744 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 A0A1B0GVL5 298 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 MCAMP43121 646 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 UBE3CQ15386 1083 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 NLRP10Q86W26 655 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 AOPEPQ8N6M6 819 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 TTLL11Q8NHH1 800 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 BPIFA3Q9BQP9 254 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 BCL2L12Q9HB09 334 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 TNNT1P13805 278 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 NDUFA8P51970 172 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 GSDMDP57764 484 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 PIGBQ92521 554 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 KIAA1468Q9P260 1216 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 SLAIN2Q9P270 581 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 ASAP1Q9ULH1 1129 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 APPP05067 770 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 ANO1Q5XXA6 986 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 PI16Q6UXB8 463 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF710Q8N1W2 664 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 JMYQ8N9B5 988 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 GREM2Q9H772 168 aa17.84■□□□□ 0.45
C9orf3-218ENST00000482056 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 GPTP24298 496 aa17.83■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 TSC1Q92574 1164 aa17.83■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 IDH1O75874 414 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 CMA1P23946 247 aa17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 SYCP1Q15431 976 aa17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM87BQ96K49 555 aa17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 IMPACTQ9P2X3 320 aa17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PDE8AO60658 829 aa17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ALG1Q9BT22 464 aa17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ITGB4P16144 1822 aa17.82■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PDE8BO95263 885 aa17.81■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 SKILP12757 684 aa17.81■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM29Q14134 588 aa17.81■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC69A6NI79 296 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF202O95125 648 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 NLRP12P59046 1061 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 SLC39A14Q15043 492 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 HLFQ16534 295 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PDCL2Q8N4E4 241 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 VGLL2Q8N8G2 317 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC112Q8NEF3 446 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 AIDAQ96BJ3 306 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 TIGD1Q96MW7 591 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 LRP6O75581 1613 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 MROH5Q6ZUA9 1318 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF532Q9HCE3 1301 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PDE6AP16499 860 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 TBC1D10CQ8IV04 446 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 LPIN2Q92539 896 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 FBXW7Q969H0 707 aa17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 KIF28PB7ZC32 967 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ZBTB43O43298 467 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 NRDCO43847 1150 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PFKFB1P16118 471 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ALX1Q15699 326 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 CEP135Q66GS9 1140 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC102BQ68D86 513 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 SYNE4Q8N205 404 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD7Q92527 254 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 NBPF3Q9H094 633 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ERVV-1B6SEH8 477 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 PPP6R2O75170 966 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 APOA5Q6Q788 366 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC150Q8NCX0 1101 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 AK7Q96M32 723 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 ARID3AQ99856 593 aa17.79■□□□□ 0.44
C9orf3-218ENST00000482056 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms