RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 PF4P02776 101 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 ELOA3Q8NG57 546 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 TTC9Q92623 222 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 DCAF5Q96JK2 942 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.22□□□□□ -1.41
ITGB3BP-211ENST00000478538 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 NME2P22392 152 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SOX9P48436 509 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRC3Q9BY71 257 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GGA1Q9UJY5 639 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SAMM50Q9Y512 469 aa6.21□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGF1RP08069 1367 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ADAMTS2O95450 1211 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 EPHA1P21709 976 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 RBL2Q08999 1139 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 RASIP1Q5U651 963 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 DPH6Q7L8W6 267 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SULF2Q8IWU5 870 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 LNPKQ9C0E8 428 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.2□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 H3BRJ5 948 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 BMP6P22004 513 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDC27P30260 824 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CRKP46108 304 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GRIK5Q16478 980 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GINM1Q9NU53 330 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 UBP1Q9NZI7 540 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.19□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM177BA6PVY3 158 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 EPXP11678 715 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CABP4P57796 275 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 APOBRQ0VD83 1088 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 IKBKEQ14164 716 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 STK35Q8TDR2 534 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.18□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM221AA4D161 298 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 F13A1P00488 732 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ALBP02768 609 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 MPP2Q14168 576 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRC14Q15048 493 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 PDZD3Q86UT5 571 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 LMNB1P20700 586 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ALAS2P22557 587 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARNTP27540 789 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 BAG6P46379 1132 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 AP3B2Q13367 1082 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SEPT6Q14141 434 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 SOGA3Q5TF21 947 aa6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BP-211ENST00000478538 NUDT8Q8WV74 236 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms