RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, human

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGIP1-208	ENST00000468570	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SLC24A1	O60721	1099 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	FUT4	P22083	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	IKBKE	Q14164	716 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ECM1	Q16610	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ECEL1	O95672	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	KRT1	P04264	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	CD8B	P10966	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	CES1	P23141	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ARL4D	P49703	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	GSTM4	Q03013	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ADH5	P11766	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	OSMR	Q99650	979 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	EREG	O14944	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	EDEM1	Q92611	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	TSPAN15	O95858	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	STIM2	Q9P246	746 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	MLANA	Q16655	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	MAOB	P27338	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ASPA	P45381	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	FLII	Q13045	1269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	MAP7	Q14244	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	LEFTY1	O75610	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	PDGFA	P04085	211 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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