RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 GPT2Q8TD30 523 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 LAMB1P07942 1786 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 E7EWF7 191 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 PDE6AP16499 860 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF445P59923 1031 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD1Q15327 319 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 GTF3C6Q969F1 213 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 NEK1Q96PY6 1258 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 GPAA1O43292 621 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 STX6O43752 255 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CTDNEP1O95476 244 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 F13A1P00488 732 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 FGAP02671 866 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A1P13866 664 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 ANTXR2P58335 489 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNDQ07001 517 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 DOK7Q18PE1 504 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 FAM182BQ5T319 152 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 SMIM5Q71RC9 77 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 NECAB1Q8N987 351 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA5Q8NB90 893 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 NID2Q14112 1375 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRC-210ENST00000462363 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GNPATO15228 680 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GJB2P29033 226 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ4P48050 445 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 UBE4AQ14139 1066 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 CRY2Q49AN0 593 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GORABQ5T7V8 394 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZUG5 572 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ARXQ96QS3 562 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 NYXQ9GZU5 481 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 FOCADQ5VW36 1801 aa6.71□□□□□ -1.34
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