RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF576Q9H609 170 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 COBLO75128 1261 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 ITPKAP23677 461 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 RXRBP28702 533 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIK1P39086 918 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 B3GALT4O96024 378 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP11A1P05108 521 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 DRD2P14416 443 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 MAOBP27338 520 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 POU4F3Q15319 338 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 CSRNP1Q96S65 589 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCB6Q9NP58 842 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 MED26O95402 600 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 BRD1O95696 1058 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 CTSBP07858 339 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 USP11P51784 963 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR19A6NJB7 356 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 ADH5P11766 374 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 TMC7Q7Z402 723 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 MFSD14AQ96MC6 490 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 CORO1BQ9BR76 489 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 DCTN4Q9UJW0 460 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 CDPF1Q6NVV7 123 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAK1Q9UPV9 953 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR64B1ANS9 1081 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 ECEL1O95672 775 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 GRM2Q14416 872 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 NFKBIBQ15653 356 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 PAOXQ6QHF9 649 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXL6Q8N531 539 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 RAD18Q9NS91 495 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 MAPK1P28482 360 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 AP3B2Q13367 1082 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 ATG3Q9NT62 314 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-204ENST00000461653 F13BP05160 661 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 SPINK2P20155 84 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE3AQ14432 1141 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 PI16Q6UXB8 463 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 FAAP100Q0VG06 881 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 DYMQ7RTS9 669 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB6AP20340 208 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 FCGRTP55899 365 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 DSC3Q14574 896 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 PIM2Q9P1W9 311 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 AOC2O75106 756 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 DTX1Q86Y01 620 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR18Q9BV38 432 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 TREHO43280 583 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 PLCB3Q01970 1234 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 SHISA5Q8N114 240 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 BCO2Q9BYV7 579 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.93□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 NFICP08651 508 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 ASPAP45381 313 aa7.92□□□□□ -1.14
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP7Q14244 749 aa7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.3 ms