RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 RXRBP28702 533 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 CD97P48960 835 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 ZNF576Q9H609 170 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 MED26O95402 600 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 CTSBP07858 339 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 DRD2P14416 443 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC3-211ENST00000460328 BTBD11A6QL63 1104 aa6.89□□□□□ -1.31
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TTC3-211ENST00000460328 COBLO75128 1261 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 ITPKAP23677 461 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 MAOBP27338 520 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 POU4F3Q15319 338 aa6.89□□□□□ -1.31
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TTC3-211ENST00000460328 ABCB6Q9NP58 842 aa6.89□□□□□ -1.31
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TTC3-211ENST00000460328 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.88□□□□□ -1.31
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TTC3-211ENST00000460328 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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TTC3-211ENST00000460328 WDR64B1ANS9 1081 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 BRD1O95696 1058 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 ADH5P11766 374 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 USP11P51784 963 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 MCTP1Q6DN14 999 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.87□□□□□ -1.31
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TTC3-211ENST00000460328 CORO1BQ9BR76 489 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 GRIK1P39086 918 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 GRM2Q14416 872 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 NFKBIBQ15653 356 aa6.86□□□□□ -1.31
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TTC3-211ENST00000460328 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 PI16Q6UXB8 463 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 FBXL6Q8N531 539 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 RAD18Q9NS91 495 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 F13BP05160 661 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 MAPK1P28482 360 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 FAAP100Q0VG06 881 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 PDE3AQ14432 1141 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 PAOXQ6QHF9 649 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 SHISA5Q8N114 240 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC3-211ENST00000460328 SPINK2P20155 84 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 RAB6AP20340 208 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 FCGRTP55899 365 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 AP3B2Q13367 1082 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 DYMQ7RTS9 669 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 ATG3Q9NT62 314 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 WDR18Q9BV38 432 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 PIM2Q9P1W9 311 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 AOC2O75106 756 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 ADAMTS4O75173 837 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 NFICP08651 508 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 ADMP35318 185 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 DSC3Q14574 896 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC3-211ENST00000460328 DTX1Q86Y01 620 aa6.81□□□□□ -1.32
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