RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446439.1

RPS29P28-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P28, Length 141 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P28-201ENST00000446439 ACTL7BQ9Y614 415 aa2.34□□□□□ -2.03
RPS29P28-201ENST00000446439 A6NJR5 290 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 TNFRSF10BO14763 440 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 LGR5O75473 907 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 NFICP08651 508 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PRKCQQ04759 706 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 BNIP3Q12983 259 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC23A3Q6PIS1 610 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ANKLE2Q86XL3 938 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC7A3Q8WY07 619 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 BSNDQ8WZ55 320 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CRIM1Q9NZV1 1036 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa2.33□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 INHBBP09529 407 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ACPPP15309 386 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 IKBKEQ14164 716 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ECM1Q16610 540 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 C16orf46Q6P387 395 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 XKR5Q6UX68 686 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PI4K2BQ8TCG2 481 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 NXPE3Q969Y0 559 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 POM121Q96HA1 1249 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CSRNP1Q96S65 589 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 USP26Q9BXU7 913 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 SAP130Q9H0E3 1048 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ELP3Q9H9T3 547 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM105AQ9NUU6 356 aa2.32□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 MED14OSP0DP75 135 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ZAP70P43403 619 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CTSWP56202 376 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 OCLNQ16625 522 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 MLANAQ16655 118 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CYP27C1Q4G0S4 372 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 HHIPQ96QV1 700 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CD320Q9NPF0 282 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM63CQ9P1W3 806 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CNTN3Q9P232 1028 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 KANSL3Q9P2N6 904 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 C1QTNF9P0C862 333 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 RAB6AP20340 208 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 KCNMB1Q16558 191 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 SWI5Q1ZZU3 235 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 DBX2Q6ZNG2 339 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PMEPA1Q969W9 287 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 HRASLS5Q96KN8 279 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 C20orf173Q96LM9 149 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 TNKS2Q9H2K2 1166 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CHRDQ9H2X0 955 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CTNND2Q9UQB3 1225 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 U3KQE9 123 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM265A0A087WTH1 108 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CTSBP07858 339 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 GLI1P08151 1106 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 HOXA5P20719 270 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CES1P23141 567 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CD96P40200 585 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 OXCT1P55809 520 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 KRTAP10-2P60368 255 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 C1orf127Q8N9H9 656 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 GPR152Q8TDT2 470 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 SNX11Q9Y5W9 270 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 NFIBO00712 420 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ZBTB39O15060 712 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 RAD21O60216 631 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 TRPA1O75762 1119 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 CEACAM5P06731 702 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 GLDCP23378 1020 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 KCNA10Q16322 511 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 AOC3Q16853 763 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PRR23BQ6ZRT6 265 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 DYMQ7RTS9 669 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF438Q7Z4V0 828 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ABTB2Q8N961 1025 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM181AQ8N9Y4 354 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 GLMNQ92990 594 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 RELTQ969Z4 430 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 OSMRQ99650 979 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 VRTNQ9H8Y1 702 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 STIM2Q9P246 746 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 PLAGL2Q9UPG8 496 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS29P28-201ENST00000446439 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms