RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.99□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.99□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 MYRFLQ96LU7 910 aa8.99□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.99□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.99□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.99□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 A0A1W2PP55 124 aa8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 IGLV1-40P01703 118 aa8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 BMP3P12645 472 aa8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 ORC1Q13415 861 aa8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.98□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 A0A096LPE4 126 aa8.97□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 A0A1W2PPZ6 126 aa8.97□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 PCDH1Q08174 1060 aa8.97□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.97□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 EHD4Q9H223 541 aa8.97□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
NANOGP9-201ENST00000439890 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 RXRBP28702 533 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 SSTR4P31391 388 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 BEND4Q6ZU67 534 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 SLC51AQ86UW1 340 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 NPHS2Q9NP85 383 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 HMX2A2RU54 273 aa8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 ECM1Q16610 540 aa8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CCNJLQ8IV13 435 aa8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CITED4Q96RK1 184 aa8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM129BQ96TA1 746 aa8.95□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 PBRM1Q86U86 1689 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 GRIA4P48058 902 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 NFIAQ12857 509 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 TCF12Q99081 682 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CEP162Q5TB80 1403 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 GRIN2BQ13224 1484 aa8.94□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 GPR182O15218 404 aa8.93□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 TGFB1P01137 390 aa8.93□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 MEGF11A6BM72 1044 aa8.92□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 RNF43Q68DV7 783 aa8.92□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.92□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.92□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.92□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 USP11P51784 963 aa8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 SGO2Q562F6 1265 aa8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.91□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 DLGAP3O95886 979 aa8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CYP11A1P05108 521 aa8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 MAOBP27338 520 aa8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CORO1BQ9BR76 489 aa8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.9□□□□□ -0.98
NANOGP9-201ENST00000439890 CLIP1P30622 1438 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 DRD2P14416 443 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 GRIK1P39086 918 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 POU4F3Q15319 338 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF576Q9H609 170 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 RAD18Q9NS91 495 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 ADAMTS12P58397 1594 aa8.89□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 COBLO75128 1261 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 BRD1O95696 1058 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 MAPK1P28482 360 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 CSRNP1Q96S65 589 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.88□□□□□ -0.99
NANOGP9-201ENST00000439890 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms