RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SAMM50Q9Y512 469 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG1L2C9J202 215 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SPINT1O43278 529 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP20O60882 483 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CILPO75339 1184 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PAGE1O75459 146 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF4AO95239 1232 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 MSX1P28360 303 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PMLP29590 882 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIA4P48058 902 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 RHBDL3P58872 404 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CLCQ05315 142 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TM4SF20Q53R12 229 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 REC114Q7Z4M0 266 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 NINJ1Q92982 152 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 MFSD3Q96ES6 412 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.26□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 BPNT1O95861 308 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 STAT3P40763 770 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNQ4P56696 695 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 HYAL2Q12891 473 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 BIRC2Q13490 618 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CCINQ13939 588 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 NIM1KQ8IY84 436 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCC9O60706 1549 aa6.25□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A096LPE4 126 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PPZ6 126 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF3BO15066 747 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PSAPP07602 524 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 RARAP10276 462 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX5P35711 763 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SOX18P35713 384 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 KANK3Q6NY19 840 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF576Q9H609 170 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 MCM8Q9UJA3 840 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.24□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PQH9 124 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 B2RBV5 119 aa6.23□□□□□ -1.41
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CBX1P4-201ENST00000439415 SLC19A1P41440 591 aa6.23□□□□□ -1.41
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CBX1P4-201ENST00000439415 EPHB1P54762 984 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 NFKB2Q00653 900 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 FAAP100Q0VG06 881 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC14Q15048 493 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PERM1Q5SV97 790 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP8Q86W28 1048 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 GSX2Q9BZM3 304 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.23□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL12A8MUP2 240 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 RFPL3O75679 317 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDH1L1O75891 902 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 ATE1O95260 518 aa6.22□□□□□ -1.41
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