RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 IQCB1Q15051 598 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC102BQ68D86 513 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 SARM1Q6SZW1 724 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 ANO10Q9NW15 660 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 DRC7Q8IY82 874 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 PDE6AP16499 860 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 PTGS1P23219 599 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 ALX1Q15699 326 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 NBPF3Q9H094 633 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 PPFIA3O75145 1194 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 FGFR2P21802 821 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 STK38Q15208 465 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 ZMYM6O95789 1325 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 CDKL5O76039 1030 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 PHKA1P46020 1223 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 C4AP0C0L4 1744 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 C4BP0C0L5 1744 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM87BQ96K49 555 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 APPP05067 770 aa26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC5A1P13866 664 aa26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-202ENST00000399409 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 SPTLC2O15270 562 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 AIDAQ96BJ3 306 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 CLIC4Q9Y696 253 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 BECN2A8MW95 431 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA5Q8NB90 893 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP3K12Q12852 859 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 SDF4Q9BRK5 362 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 ANO1Q5XXA6 986 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 APOA5Q6Q788 366 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1B0GVL5 298 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 NEMFO60524 1076 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 NDUFA8P51970 172 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 ALG1Q9BT22 464 aa26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-202ENST00000399409 PARP10Q53GL7 1025 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 B4E1Z4 1266 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF28PB7ZC32 967 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 SUSD4Q5VX71 490 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 DOCK2Q92608 1830 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB43O43298 467 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 CMA1P23946 247 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 SLIT2O94813 1529 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 LIFRP42702 1097 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-202ENST00000399409 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms