RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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SNX11-201ENST00000359238 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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SNX11-201ENST00000359238 NBPF3Q9H094 633 aa21.81■■□□□ 1.08
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.8■■□□□ 1.08
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SNX11-201ENST00000359238 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SNX11-201ENST00000359238 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SNX11-201ENST00000359238 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
SNX11-201ENST00000359238 UBE4AQ14139 1066 aa21.78■■□□□ 1.08
SNX11-201ENST00000359238 UBE3CQ15386 1083 aa21.78■■□□□ 1.08
SNX11-201ENST00000359238 CRY2Q49AN0 593 aa21.78■■□□□ 1.08
SNX11-201ENST00000359238 INCENPQ9NQS7 918 aa21.78■■□□□ 1.08
SNX11-201ENST00000359238 JAG2Q9Y219 1238 aa21.78■■□□□ 1.08
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