RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR24Q96S15 920 aa20.54■□□□□ 0.88
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM139Q8IV31 216 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DRC1Q96MC2 740 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB21Q9UL25 225 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCA3Q99758 1704 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A0D9SFI3 127 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NECTIN2Q92692 538 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.53■□□□□ 0.88
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 TEFQ10587 303 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCRN1Q12765 414 aa20.53■□□□□ 0.88
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEK1Q96PY6 1258 aa20.52■□□□□ 0.88
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERLIN1O75477 346 aa20.51■□□□□ 0.87
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.51■□□□□ 0.87
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MCTP2Q6DN12 878 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP89Q96ST8 783 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 L1RE1Q9UN81 338 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1B0GVL5 298 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BTBD11A6QL63 1104 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DHX58Q96C10 678 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRRC31Q6UY01 552 aa20.49■□□□□ 0.87
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 TAF5LO75529 589 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP1A3P13637 1013 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHKG2P15735 406 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AACSQ86V21 672 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FSD1Q9BTV5 496 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPFIA4O75335 1185 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SERPINC1P01008 464 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFAP100Q494V2 611 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP112Q8N8E3 955 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM107BQ9H098 131 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CUTAO60888 179 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.47■□□□□ 0.87
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 MED4Q9NPJ6 270 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYL5Q02045 173 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TUBB2AQ13885 445 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYP27B1O15528 508 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTDNEP1O95476 244 aa20.46■□□□□ 0.87
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