RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD1Q15327 319 aa25.31■■□□□ 1.64
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SOX17-201ENST00000297316 RAI14Q9P0K7 980 aa25.31■■□□□ 1.64
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SOX17-201ENST00000297316 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.21■■□□□ 1.63
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SOX17-201ENST00000297316 GRIK5Q16478 980 aa25.2■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.2■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 ATP2B4P23634 1241 aa25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 ANTXR2P58335 489 aa25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 ALX1Q15699 326 aa25.19■■□□□ 1.62
SOX17-201ENST00000297316 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
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