RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 POLLQ9UGP5 575 aa25.13■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 GGA1Q9UJY5 639 aa25.13■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 PDE6BP35913 854 aa25.12■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 NPR1P16066 1061 aa25.12■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 PRDX5P30044 214 aa25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 Q6ZUG5 572 aa25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 NECAB1Q8N987 351 aa25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ATP2B4P23634 1241 aa25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 CHST3Q7LGC8 479 aa25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.11■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.1■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF213O14771 459 aa25.1■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ST3GAL1Q11201 340 aa25.1■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 SP8Q8IXZ3 490 aa25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 NBPF3Q9H094 633 aa25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.09■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 C6orf229H3BNL8 230 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 MECOMQ03112 1051 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.618e-7■□□□□ 10.9
RFXAP-201ENST00000255476 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 LTBP1Q14766 1721 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD1Q15327 319 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 MASTLQ96GX5 879 aa25.08■■□□□ 1.61
RFXAP-201ENST00000255476 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 STK3Q13188 491 aa25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 BRF1Q92994 677 aa25.07■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 NUCB2P80303 420 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 CD209Q9NNX6 404 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 ALDH1B1P30837 517 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 FGD1P98174 961 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 TMC4Q7Z404 712 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 NAPBQ9H115 298 aa25.06■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 MCM4P33991 863 aa25.05■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.05■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 CHRNA5P30532 468 aa25.04■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 ALX1Q15699 326 aa25.04■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 GRIK5Q16478 980 aa25.04■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 INCENPQ9NQS7 918 aa25.04■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 RIMBP2O15034 1052 aa25.04■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 GNAT2P19087 354 aa25.03■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 TDO2P48775 406 aa25.03■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 H0YIN7 160 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 NCOA7Q8NI08 942 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 CHD4Q14839 1912 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 APOBRQ0VD83 1088 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 MPNDQ8N594 471 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.02■■□□□ 1.6
RFXAP-201ENST00000255476 SLX4Q8IY92 1834 aa25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 IL1R1P14778 569 aa25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 GSE1Q14687 1217 aa25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 ZMYM6O95789 1325 aa25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 ZBTB22O15209 634 aa25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.01■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 SALL1Q9NSC2 1324 aa25■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 ANTXR2P58335 489 aa25■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25■■□□□ 1.59
RFXAP-201ENST00000255476 GJB2P29033 226 aa25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms