RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 DDX11Q96FC9 970 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 ARMT1Q9H993 441 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 FIBPO43427 364 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 NFIXQ14938 502 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 ADRA2BP18089 450 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 UBE2HP62256 183 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 LCORLQ8N3X6 602 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 EP400Q96L91 3159 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXC11-201ENST00000243082 PRKAB2O43741 272 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 KLRK1P26718 216 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 TRDNQ13061 729 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 SYCE3A1L190 88 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 GNAT2P19087 354 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 VPS37DQ86XT2 251 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 NAPBQ9H115 298 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 ABCF2Q9UG63 623 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 NPHP1O15259 732 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 CYP7A1P22680 504 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 KRT85P78386 507 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 RESTQ13127 1097 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 RAI14Q9P0K7 980 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 NEDD4P46934 1319 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 H3BQV1 296 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 SEMA3EO15041 775 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 IFFO2Q5TF58 517 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 CNBD1Q8NA66 436 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 INCENPQ9NQS7 918 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 B4E1Z4 1266 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM37O94972 964 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 GYS1P13807 737 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 TTC6Q86TZ1 520 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 KIF3AQ9Y496 699 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF384Q8TF68 577 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 RBSNQ9H1K0 784 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 CACNA1SQ13698 1873 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 ELP1O95163 1332 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 PPFIA3O75145 1194 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 GRAPQ13588 217 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXC11-201ENST00000243082 TDO2P48775 406 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXC11-201ENST00000243082 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms