RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-201ENST00000216840 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
RABGGTA-201ENST00000216840 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-201ENST00000216840 CTDNEP1O95476 244 aa20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-201ENST00000216840 ST5P78524 1137 aa20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-201ENST00000216840 FERMT3Q86UX7 667 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF445P59923 1031 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-201ENST00000216840 AKT1S1Q96B36 256 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-201ENST00000216840 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-201ENST00000216840 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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