RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cfap157Q0VFX2 523 aa17.27■□□□□ 0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam76aQ922G2 307 aa17.27■□□□□ 0.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa17.27■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Adora1Q60612 326 aa17.27■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nek5Q7TSC3 627 aa17.27■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hip1rQ9JKY5 1068 aa17.27■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm28919A0A087WP35 240 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc170D3YXL0 722 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc113Q8C5T8 377 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm38392E9Q2A2 434 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Idi1P58044 227 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arpp21Q9DCB4 807 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm44503E9PYU5 387 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncaph2Q8BSP2 607 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc94Q9D6J3 314 aa17.26■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Parp2O88554 559 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 EspnlQ3UYR4 1005 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 VrtnQ3SYK4 740 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp2b4Q6Q477 1205 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plcd1Q8R3B1 756 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rab3il1Q8VDV3 383 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Azi2Q9QYP6 405 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt13P08730 437 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SsbP32067 415 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NppbP40753 121 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stox1B2RQL2 990 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ChkbO55229 394 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rad17Q6NXW6 688 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 IqcgQ80W32 419 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt7Q9DCV7 457 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cnpy2Q9QXT0 182 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Setdb1O88974 1307 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pagr1bF6V0H0 108 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pagr1aQ99L02 253 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PtprgQ05909 1442 aa17.25■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Oxr1Q4KMM3 866 aa17.24■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tom1l2Q5SRX1 507 aa17.24■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa17.24■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fez2Q6TYB5 348 aa17.24■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vat1lQ80TB8 417 aa17.24■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Enox2Q8R0Z2 598 aa17.24■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SnrkQ8VDU5 748 aa17.24■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Clcn1Q64347 994 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gse1Q3U3C9 1213 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cyp24a1Q64441 514 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pdcl2Q78Y63 240 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ubxn1Q922Y1 297 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Serpinb6bO08804 377 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppfibp2O35711 882 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Spa17Q62252 149 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mx2Q9WVP9 655 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfpm1O35615 995 aa17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stk36Q69ZM6 1316 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 1700029H14RikE9PY36 240 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arl1P61211 181 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ube3aO08759 870 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc129Q14B48 1034 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam135bQ9DAI6 1403 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GancQ8BVW0 898 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arhgef6Q8K4I3 771 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Med10Q9CXU0 135 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MpndQ3TV65 487 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccpg1Q640L3 753 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FibpQ9JI19 357 aa17.22■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mroh7A2AVR2 1279 aa17.21■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tdo2P48776 406 aa17.21■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Spata24Q6P926 205 aa17.21■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 LdhaP06151 332 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GabpaQ00422 454 aa17.21■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kif17Q99PW8 1038 aa17.21■□□□□ 0.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tagap1P0CAX8 505 aa17.21■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Top1Q04750 767 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fgfr1opQ66JX5 399 aa17.21■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Appbp2Q9DAX9 585 aa17.21■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm5934D3Z4U6 212 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Apol10bG3X9K7 334 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gucy1b3O54865 620 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pdrg1P59048 133 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kcnj14Q8JZN3 434 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ifih1Q8R5F7 1025 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pcdhb2Q91Y00 799 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sik1Q60670 779 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Asic4Q7TNS7 539 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttc14Q9CSP9 761 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Efhd1Q9D4J1 240 aa17.2■□□□□ 0.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TrdnE9Q9K5 693 aa17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.5 ms