RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrrc2Q8VDB8 371 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccer1Q9CQL2 403 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pramel3A2AHA7 463 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm7903A2AWL1 463 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AV320801A2AWL3 467 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15023L7MUB4 467 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Metap2O08663 478 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Casp1P29452 402 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8BT18 775 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CerkQ8K4Q7 531 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Med23Q80YQ2 1367 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myh2G3UW82 1942 aa15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm13023A2A8N2 498 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Siah1aP61092 282 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dusp10Q9ESS0 483 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lgr5Q9Z1P4 907 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdc45Q9Z1X9 566 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aox4Q3TYQ9 1336 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cacna1sQ02789 1880 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CrcpO35427 148 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cfap157Q0VFX2 523 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Agtpbp1Q641K1 1218 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bola3Q8CEI1 110 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube4aE9Q735 1028 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccng2O08918 344 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Npy5rO70342 466 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc4a4O88343 1079 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Me1P06801 572 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sept9Q80UG5 583 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krt84Q99M73 603 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GakQ99KY4 1305 aa15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CebpaP53566 359 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp1b3P97370 278 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc174Q3U155 467 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cep63Q3UPP8 700 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hook1Q8BIL5 728 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hps3Q91VB4 1002 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Naa16Q9DBB4 864 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gja10Q9WUS4 505 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scn11aQ9R053 1765 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CpdO89001 1377 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gimap8Q75N62 688 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acnat2Q8BGG9 420 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpatch3Q8BIY1 525 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mknk2Q8CDB0 459 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Osbpl5Q9ER64 874 aa15.87■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rgs12Q8CGE9 1381 aa15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EzrP26040 586 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IntuQ059U7 942 aa15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sirt2Q8VDQ8 389 aa15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plch1Q4KWH5 1682 aa15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Foxo3Q9WVH4 672 aa15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FAM186AQ9D9R9 1790 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zbtb21E9Q444 1094 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clec11aO88200 328 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Oxsr1Q6P9R2 527 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnf1Q7TSH7 493 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prkag3Q8BGM7 489 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 9230110C19RikQ8CC70 267 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stk38Q91VJ4 465 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dbndd1Q9CZ00 160 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myh3P13541 1940 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pde4bB1AWC9 736 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp24a1Q64441 514 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdca8Q8BHX3 289 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfm5Q8BU90 496 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tsen34Q8BMZ5 316 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr108Q91WD0 569 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tktl2Q9D4D4 627 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Efcc1Q9JJF6 558 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Suclg2Q9Z2I8 433 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ParvgQ9ERD8 331 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dpf1Q9QX66 387 aa15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc44a1Q6X893 653 aa15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ubxn4Q8VCH8 506 aa15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd3dP04235 173 aa15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnm1P39053 867 aa15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stat5bP42232 786 aa15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28047Q3US59 414 aa15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plcd3Q8K2J0 785 aa15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd63A2ARS0 390 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.4 ms