RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF183Q96D59 192 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 UQCC2Q9BRT2 126 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 UBQLN2Q9UHD9 624 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 SCTP09683 121 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 MYL12AP19105 171 aa16.18■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 ARL3P36405 182 aa16.18■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC29A1Q99808 456 aa16.18■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM213A2RRL7 107 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP8B1O43520 1251 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 LALBAP00709 142 aa16.16■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 MED22Q15528 200 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM177Q53S58 311 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 OR4A47Q6IF82 309 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC19AQ6UXS0 136 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 OR2C3Q8N628 320 aa16.16■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 MFFQ9GZY8 342 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 OR2D2Q9H210 308 aa16.16■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 AK3Q9UIJ7 227 aa16.16■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 DPPA5A6NC42 116 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 LINC00336Q6ZUF6 198 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A42Q86VD7 318 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-205ENST00000588780 C11orf45Q8TAV5 145 aa16.15■□□□□ 0.18
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CAPNS1-205ENST00000588780 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC9CQ8N5M4 171 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.14■□□□□ 0.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.13■□□□□ 0.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 CRYZL1O95825 349 aa16.13■□□□□ 0.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.13■□□□□ 0.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 MED21Q13503 144 aa16.12■□□□□ 0.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 GSTT2BP0CG30 244 aa16.11■□□□□ 0.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 TM2D1Q9BX74 207 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-205ENST00000588780 HMX3A6NHT5 357 aa16.1■□□□□ 0.17
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